银行是很难破产的，因此分开存或存在一起要看题主需求。

但从存款保险条例来说，分开存更好：

储蓄人员的存款本息在50万元及50万元以内。根据政府五年前颁布并开始使用的《条例》可以知道，银行的破产是被允许的，并且银行破产的时候储蓄人员的存款会受到相应保护，会得到最高50万的保险赔付。该保险是银行购买的《存款保险》，50万元以及50万元以内的存款都会得到等额的保险赔付。